Konsep dan teknis pelaksanaan program Sekolah Penggerak belum dipahami secara maksimal oleh kelompok pendidik.

Program Organisasi Penggerak Kemendikbud menuai polemik, ditandai dengan mundurnya Muhammadiyah dan Nahdlatul Ulama sebagai peserta. Perbaikan mutu guru semestinya diarahkan agar mempunyai peta kebijakan jangka panjang.

Program Organisasi Penggerak yang digagas Kemendikbud menimbulkan polemik. Proses seleksi kepesertaan program dinilai tidak transparan. Muhammadiyah dan Nahdlatul Ulama memilih mundur dari kepesertaan.

Program Organisasi Penggerak Kemdikbud mendapat sorotan tajam karena penilaian proposal organisasi masyarakat dianggap tidak jelas. Majelis Pendidikan Dasar dan Menengah PP Muhammadiyah memilih mundur dari kepesertaan.