Tim Ahli Cagar Budaya DKI Jakarta mengidentifikasi revitalisasi halte Stasiun Jatinegara dengan struktur menjulang menutupi gereja yang telah ditetapkan sebagai cagar budaya.

Transjakarta enggan berpolemik dan memilih menyelesaiakan revitalisasi halte tahap 1 agar bisa segera beroperasi. Halte Tosari dan Bundaran HI yang direvitalisasi berpotensi usik kawasan bersejarah Bundaran HI.

Karena sudah dikaji dan diusulkan, status Bundaran HI adalah obyek diduga cagar budaya atau ODCB. Revitalisasi halte Transjakarta di sekitar Bundaran HI dinilai melanggar perlindungan dan pelestarian cagar budaya.

Jalur fase 2A Glodok ke Kota ini mengarah ke Kota Tua Jakarta. Di jalur itu tertimbun sisa rel trem lama, tinggalan budaya yang penting bagi sejarah Jakarta. Ekskavasi dilakukan untuk menyelamatkan benda bersejarah itu.

Untuk pengembangan usaha dan dalam rangka menjadikan Sarinah sebagai ikon Jakarta, pengelola memugar gedung yang dibangun tahun 1960-an itu. Nilai sejarah tetap dipertahankan untuk ”dijual” sebagai daya tarik wisatawan.