Ada persoalan struktural dan tata kelola yang menghambat tujuan proyek lumbung pangan. Pengelola perlu melakukan pengembangan modal sosial petani terlebih dahulu, termasuk penyelesaian klaim hak-hak atas tanah dan hutan.

Dari hasil pemikiran Hariadi Kartodihardjo, persoalan lingkungan dan kehutanan tidak hanya bisa diperbaiki dari aspek teknis, tetapi juga politis yang menyangkut tata kelola dan kepemimpinan.